Ну как можно исключить Midnight Commander?
В репах он есть, пакет называется mc (Если все-таки нету, убедитесь, что у Вас подключены источники Core и Core Updates)

Запустить от рута можно командами:

su
mc

Про mc Вам уже всё рассказали, никуда он не делся. Можете его запустить как сказано из консоли через su, можете по Alt+F2 указав запуск в терминале и от рута, указав ещё и запуск от другого (рута) пользователя. Но удобнее всего просто установить Krusader, он автоматом встаёт в меню в двух ипостасях: сам по себе и в рутовом режиме (в Магее по умолчанию Меню - Утилиты - Системные). Полезно сразу поставить и весь набор архиваторов к нему начиная с rar, а также kdiff, krename и прочее. Увидите при первом запуске. Но как файлменеджер он конечно будет работать и так.

Ага! А ещё из ноутбука идёт радиация, особенно если чёрная кошка дорогу перебежала!

С начала века пользуюсь mc и крусадером ещё с первой версии для KDE2 и почему-то ничего плохого при этом не случилось. Что я не так делаю?

Зато знаю тысячи случаев (из них своих с десяток), когда незамеченная опечатка в командной строке приводила к крайне печальным последствиям. Если такое написано в каких-то учебниках, то надо выкинуть такие учебники. К счастью, ни одного не читал, обхожусь мануалами.

mimo, ваша точка зрения имеет право на существование. Но, дождёмся, всё же, пока она станет общепринятой, а будет ли это хоть когда-нибудь - неизвестно.
P.S. А учебники читать нужно (на начальном этапе изучения, а потом поздно - это как со слепой печатью на клавиатуре. Если сразу не учиться, а тыкать двумя пальцами, то потом переучиться невозможно) Манов недостаточно для адекватного восприятия информации.

Я давно уже заценил вашу подпись. Графика - для домашних пользователей, администраторы предпочитают командную строку (их кстати, так учат профессионалы)

mc - он псевдографический, его любят все: и пользователи, и админы.
Понятно, что под root в любом случае работать опасно, надо полностью осознавать действия, последствия, но иногда и в в /usr/bin нужно положить скриптик - в mc это всего одна кнопка - F5, а в консоли надо знать про cp и cd. Начинающему F5 нажать предпочтительнее, чем читать про cp и cd.

По умолчанию для записи в каталог /usr/local/bin тоже нужны права root

А по какой причине Вы считаете собственную точку зрения общепринятой? Вы уверены, что авторы того же Krusader любители, которым далеко до Вашего профессионализма? Учебников, простите, не было в то время ни одного, а потом и не понадобились. И лично мне манов всегда хватало для вполне адекватного восприятия информации. Поэтому я учебники не читаю, а пишу.

Ещё раз повторю, графика нужна не только для удобства и простоты, но и как гарантия от ошибок, которые легко допустить в командной строке. Вы и control center не используете, всё командной строкой настраиваете? Простите, не поверю. А профессионализм, это не избегание удобных инструментов, а умение ими пользоваться, как и обходиться без них при крайней реальной необходимости. Или Вы считаете, что делать в бетоне дырки коловоротом профессиональнее, чем перфоратором?

То есть, использовать файлменеджеры под рутом некошерно, а конфигуратор, делающий куда более сложные операции над системой - пожалуйста? Ну и где логика?

И что криминального в запуске кедов от рута? Когда надо сделать много разного сразу, это удобно, особенно на сервере. Более того, открою страшную тайну, иногда и на простой пользовательской системе! Только вчера после установки не помню уж чего, система отказалась грузиться - kdm не стартует. Загрузился в safe mode рутом, стартанул иксы, заглушил, стартанул kdm, зашёл юзером, перезагрузился - всё заработало. Такая ситуация, кстати, бывала и на Mandriva, AltLinux, Rosa, PCLinuxOS. Какова альтернатива? Копаться в логах руками и править кривые конфиги? Увольте! Только если не сработает этот простой метод.

Проблема не в графике, а в голове и шаловливых ручках. Под sudo можно не заметив такого натворить! Поэтому вот его не допускаю никогда.

А в файлменеджере что-то иное? Ну расскажите скорее, как мне его настроить, чтобы копирование, удаление, изменение прав отличалось от результатов командной строки?

Опечатка в консоли может быть у каждого, особенно с устатку и неевши, а вот то, что описываете Вы может сделать только полный разгильдяй.

Случайно можно набрать одно вместо другого. Разницу между безграмотностью и опечатками чувствуете? Ошибка в графике - безграмотность. Это надо лечить, это недопустимо. В консоли возможны опечатки по невнимательности, от которых не застрахован никто.

Топикстартер хочет правильного, а мне не хочется, чтобы начинающих пользователей путали ложными аргументами потому, что именно для начинающих важна графика. В файлменеджере человек всегда видит, где находится, с каким каталогом или файлом собирается что-то делать. При этом команда su, к примеру, в одних дистрибутивах выбрасывает в каталог пользователя, в других - в корень (где вообще нечего делать никакому пользователю/администратору), отображается только последний каталог, так что наворотить - море возможностей.

Так что, вопрос графики под рутом вопрос не религии, а безопасности.