Куда исчезло, где искать и т.п. - сам не знаю. Но это похоже сбились настройки рабочего стола (кстати, это происходит при удалении любой Домашней папки, а они с настройками рабочего стола). А потому лечится удалением невидимой папки  .kde в /home/user - Домашняя папка (система автоматом создаёт новую) и настраиваешь заново, начиная с Рабочего стола - лучше всего выбери Вид - Папка
Но начни без удаления папки .kde , сначала просто Рабочий стол перенастрой на Вид - Папка

Бывает иногда, что при виде "папка", иногда пропадают все значки с раб стола.
При этом с правой стороны есть ползунок, который видимо можно крутить.

Заметил, что лечится это просто:
1) Настроить виджет "Папка" (Правой кнопкой мыши на раб столе, пункт в самом низу)
2) Меняем тип комнаты с "Папка" на "Газета"
3) Применить
Вновь заходим сюда же (окно с настройками у меня пропадает после нажатия применить)
4) Теперь выбираем тип комнаты "Папка" и нажимаем внизу применить.

Данный косяк имеется на двух железках(ноут и стационарный комп) и там и тут KDE
Удаление папки .kde вариант, но настраивать потом не очень хочется.
А вариант такой - быстр и настройки не слетают.

ПС: Выбираю именно типа коматы "Газета" по причине, что другие не всегда помогали (с чем это связанно - вопрос хороший, но ответа не знаю.)

Переодичности или закономерности не заметил, сейчас нормально - через неделю может повториться или завтра даже.