Найти не сложно. Изменяем в МСС частоту проверки обновлений, закрываем МСС. Запускаем поисковик, ищем файлы, измененные за n  минут( я обычно kfind использую). Находим /etc/sysconfig/mgaapplet.

Я думаю, это неспроста. Обновления безопасности весьма важны для "здоровья" системы и лучше их применять вовремя. Хотя, конечно: хозяин - барин.

Разумное поведение для администратора сервера.
А вот, для пользователя домашнего писюка, не вижу смысла в частых обновах.
Есть хорошая поговорка: Работает - не трогай.
В подтверждение могу сослаться на недавний апдейт вордпресса до 4.5
Обновился... исчезли картинки на всём сайте, перестал работать аякс-логин, заглючил плагин с картами.
По сути, обновление движка, ну ни как не должно влиять на отображение темы. Однако... Я в шоке, начал разбираться.
Выяснилось, что с обновлением была обновлена и либа jquery, в которой разрабы решили чуток подправить синтаксис.
Короче, 4 скрипта пришлось патчить руками.
100 лет бы не обновлял я этот вордпресс, если бы был уверен в отсутствии уязвимостей. Зачем мне это? Всё, код написан, сайт работает. А обновления эти гораздо чаще создают, чем решают проблемы.

Если левых доп реп не подключено и выключен тестинг, то вполне себе стабильный. С фьюженом без тестинга и не сразу после релиза (через пару месяцев, когда все соберут как надо под актуальный релиз), тоже вполне ок. С другими репозиториями, конечно, могут быть проблемы.
Тестрование пакетов перед включением в updates в федоре как раз серьезней чем в магее, другой вопрос, что много свежих версий из апстрима приходит, которые сами по себе могут не иметь обратную совместимость с предыдущими версиями софта, что и вызовет поломку, но это настолько редкий случай, что можно просто забить.

я имел ввиду не глючность, а обновление на новые версии софта. По глючности федора вполне себе безглючна, учитывая, что у меня левых реп как собак не резанных подключено. Тестинг естественно не подключаю.

тогда удаляй пакет mgaonline