Здравствуйте. У меня такая ситуация. Жесткий диск физически один, разделен на 2 части во время установки WIndows 8.1.
500гб на Win 8 и 870гб на Файлы пользователя. Затем я Акронисом отрезал 20гб (точно не помню от какого раздела) под Линукс.
В БИОС в разделе UEFI пришлось перевести UEFI из режима загрузки Только Windows в режим "Другие ОС". Это необходимо для того, что бы он соглашался грузить Линуксы, для Винды настройки БИОС по умолчанию работают и так.
Во время установки Магея выбрал ручную установку, выбрал диск на 20 гигов и выбрал автораспределение. Все установилось, пока проблем нет. Сразу перезагрузка.
Во время Первого эе перезапуска появился загрузчик Магеи, в нем я выбрал Windows Boot Manager и вылетела ошибка, мол ядро еще не загружено.
Единственное как я смог загрузить Винду, так это снова вернуть БИОС по умолчанию, соответственно режим UEFI стал только Microsoft Windows.
И то, все равно при загрузке Винды, она сама себя восстановила (и скорее всего Линуксовый загрузчик потерла).